Nuestro cuerpo elimina por distintos medios las sustancias que absorbemos, incluidas aquella con motivos terapéuticos. Uno de los medios es la piel, por sus poros pueden eliminar aceites esenciales, alcanflor, yodo, algunos gases y moléculas hidrosolubles.
En el tracto digestivo a través de las heces fecales, la saliva y los jugos gástricos del estomago se eliminan atropina, cafeína, la cocaína y otros alcaloides. Con la bilis se eliminan el hierro, cobalto, los glúcidos y la quinina.
A través de la leche de la glándula mamaria pasan muchas sustancias entre ellas, glucósidos antraquinonicos (Boldo, cascara sagrada y Aloe entre otros), alcohol, nicotina y morfina.
Los riñones son los órganos principales en la eliminación ya que expulsan todas las sustancias hidrosolubles que se (disuelven en agua) y otras sin modificaciones.
Otros órganos so los pulmones eliminan aceites esenciales y algunos gases.
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